Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EBF1Q9UH73 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EBF1Q9UH73 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EBF1Q9UH73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF1Q9UH73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF1Q9UH73 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EBF1Q9UH73 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms