Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAPOLBQ9NRJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAPOLBQ9NRJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPOLBQ9NRJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms