Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIN28AQ9H9Z2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN28AQ9H9Z2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN28AQ9H9Z2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN28AQ9H9Z2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms