Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPS7BQ9H9Q2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS7BQ9H9Q2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS7BQ9H9Q2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPS7BQ9H9Q2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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