Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STN1Q9H668 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STN1Q9H668 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STN1Q9H668 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STN1Q9H668 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
STN1Q9H668 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STN1Q9H668 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms