Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN1

ACTR6, Actin-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR6Q9GZN1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTR6Q9GZN1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTR6Q9GZN1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTR6Q9GZN1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR6Q9GZN1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR6Q9GZN1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR6Q9GZN1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR6Q9GZN1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTR6Q9GZN1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms