Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B3GNT4Q9C0J1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
B3GNT4Q9C0J1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B3GNT4Q9C0J1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B3GNT4Q9C0J1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B3GNT4Q9C0J1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms