Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTRT3Q9BYD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTRT3Q9BYD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTRT3Q9BYD9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTRT3Q9BYD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTRT3Q9BYD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms