Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APOL6Q9BWW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOL6Q9BWW8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOL6Q9BWW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOL6Q9BWW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOL6Q9BWW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
APOL6Q9BWW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms