Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF4Q9BUZ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF4Q9BUZ4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAF4Q9BUZ4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF4Q9BUZ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF4Q9BUZ4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms