Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms