Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP3BQ9BS92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP3BQ9BS92 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP3BQ9BS92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP3BQ9BS92 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms