Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RHOXF2Q9BQY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RHOXF2Q9BQY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RHOXF2Q9BQY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RHOXF2Q9BQY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms