Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GORASP1Q9BQQ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GORASP1Q9BQQ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GORASP1Q9BQQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GORASP1Q9BQQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GORASP1Q9BQQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms