Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE5

APOL2, Apolipoprotein L2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL2Q9BQE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOL2Q9BQE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOL2Q9BQE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APOL2Q9BQE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOL2Q9BQE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOL2Q9BQE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOL2Q9BQE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOL2Q9BQE5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL2Q9BQE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL2Q9BQE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOL2Q9BQE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms