Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USB1Q9BQ65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USB1Q9BQ65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USB1Q9BQ65 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USB1Q9BQ65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USB1Q9BQ65 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms