Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GDF15Q99988 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GDF15Q99988 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
GDF15Q99988 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GDF15Q99988 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GDF15Q99988 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GDF15Q99988 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GDF15Q99988 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms