Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3AQ99856 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID3AQ99856 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID3AQ99856 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3AQ99856 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARID3AQ99856 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARID3AQ99856 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms