Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HHIPQ96QV1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HHIPQ96QV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HHIPQ96QV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HHIPQ96QV1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HHIPQ96QV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HHIPQ96QV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms