Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
EP400Q96L91 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
EP400Q96L91 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
EP400Q96L91 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EP400Q96L91 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
EP400Q96L91 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
EP400Q96L91 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EP400Q96L91 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EP400Q96L91 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
EP400Q96L91 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms