Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKNOX2Q96KN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKNOX2Q96KN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2Q96KN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2Q96KN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms