Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HHIPL1Q96JK4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HHIPL1Q96JK4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HHIPL1Q96JK4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HHIPL1Q96JK4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HHIPL1Q96JK4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HHIPL1Q96JK4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HHIPL1Q96JK4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HHIPL1Q96JK4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HHIPL1Q96JK4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
HHIPL1Q96JK4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms