Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUB1Q96FW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUB1Q96FW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OTUB1Q96FW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTUB1Q96FW1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms