Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC17Q96AE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC17Q96AE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC17Q96AE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TTC17Q96AE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC17Q96AE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC17Q96AE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms