Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPRN2Q92932 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRN2Q92932 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRN2Q92932 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRN2Q92932 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRN2Q92932 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRN2Q92932 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRN2Q92932 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms