Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDS1Q92903 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDS1Q92903 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDS1Q92903 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDS1Q92903 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDS1Q92903 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDS1Q92903 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms