Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRN4Q8WUT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRN4Q8WUT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRN4Q8WUT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRN4Q8WUT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRN4Q8WUT4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRN4Q8WUT4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN4Q8WUT4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms