Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDAC7Q8WUI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HDAC7Q8WUI4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HDAC7Q8WUI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HDAC7Q8WUI4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC7Q8WUI4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms