Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROKR1Q8TCW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROKR1Q8TCW9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROKR1Q8TCW9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROKR1Q8TCW9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROKR1Q8TCW9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROKR1Q8TCW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROKR1Q8TCW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms