Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACBD4Q8NC06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACBD4Q8NC06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACBD4Q8NC06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACBD4Q8NC06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACBD4Q8NC06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms