Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUMF1Q8NBK3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUMF1Q8NBK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUMF1Q8NBK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SUMF1Q8NBK3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SUMF1Q8NBK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUMF1Q8NBK3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUMF1Q8NBK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms