Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RYBPQ8N488 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RYBPQ8N488 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RYBPQ8N488 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RYBPQ8N488 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RYBPQ8N488 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms