Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KLHL34Q8N239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KLHL34Q8N239 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KLHL34Q8N239 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KLHL34Q8N239 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KLHL34Q8N239 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KLHL34Q8N239 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
KLHL34Q8N239 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KLHL34Q8N239 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KLHL34Q8N239 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
KLHL34Q8N239 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms