Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM17Q86X19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM17Q86X19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM17Q86X19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms