Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF39Q86UA1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF39Q86UA1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF39Q86UA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF39Q86UA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF39Q86UA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms