Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NPM2Q86SE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NPM2Q86SE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NPM2Q86SE8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NPM2Q86SE8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NPM2Q86SE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NPM2Q86SE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NPM2Q86SE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms