Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
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