Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SH3RF1Q7Z6J0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SH3RF1Q7Z6J0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SH3RF1Q7Z6J0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SH3RF1Q7Z6J0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SH3RF1Q7Z6J0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF1Q7Z6J0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF1Q7Z6J0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF1Q7Z6J0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms