Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSMD2Q7Z408 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSMD2Q7Z408 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSMD2Q7Z408 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSMD2Q7Z408 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSMD2Q7Z408 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSMD2Q7Z408 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms