Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IKBIPQ70UQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKBIPQ70UQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKBIPQ70UQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKBIPQ70UQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKBIPQ70UQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms