Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN5Q6U736 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPN5Q6U736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN5Q6U736 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OPN5Q6U736 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OPN5Q6U736 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms