Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL35Q6PF15 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL35Q6PF15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL35Q6PF15 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL35Q6PF15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL35Q6PF15 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL35Q6PF15 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms