Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM88Q6PEY1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM88Q6PEY1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM88Q6PEY1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM88Q6PEY1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM88Q6PEY1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms