Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RALGAPA1Q6GYQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RALGAPA1Q6GYQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RALGAPA1Q6GYQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RALGAPA1Q6GYQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms