Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NHSL1Q5SYE7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NHSL1Q5SYE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NHSL1Q5SYE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
NHSL1Q5SYE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NHSL1Q5SYE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NHSL1Q5SYE7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NHSL1Q5SYE7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
NHSL1Q5SYE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms