Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD39Q53RE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD39Q53RE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD39Q53RE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms