Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC92Q53HC0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC92Q53HC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC92Q53HC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC92Q53HC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC92Q53HC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms