Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTC4SQ16873 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LTC4SQ16873 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LTC4SQ16873 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTC4SQ16873 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LTC4SQ16873 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTC4SQ16873 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTC4SQ16873 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTC4SQ16873 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTC4SQ16873 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LTC4SQ16873 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTC4SQ16873 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTC4SQ16873 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTC4SQ16873 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTC4SQ16873 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTC4SQ16873 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTC4SQ16873 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTC4SQ16873 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTC4SQ16873 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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