Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 SLC35A4-204ENST00000623481 683 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.489e-10■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 48.4
PCBP1Q15365 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 48.4
PCBP1Q15365 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.694e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 523.18■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 419.86■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 519.14■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-206ENST00000564934 639 ntTSL 314.45□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-204ENST00000562303 5897 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 317.68■□□□□ 0.424e-17■■■■■ 47.6
PCBP1Q15365 MTG1-204ENST00000473735 2212 ntTSL 523.07■■□□□ 1.283e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.063e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-207ENST00000495014 871 ntTSL 320.83■□□□□ 0.933e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-221ENST00000521830 580 ntTSL 420.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-211ENST00000520136 468 ntTSL 319.84■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-218ENST00000521330 556 ntTSL 419.3■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-224ENST00000522577 702 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-223ENST00000522200 855 ntTSL 318.98■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.76■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.72■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-210ENST00000520118 533 ntTSL 418.54■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-208ENST00000519117 617 ntTSL 318.54■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 218.48■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-222ENST00000521847 1847 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 417.89■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-214ENST00000520484 508 ntTSL 417.67■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 517.51■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-226ENST00000523165 375 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-227ENST00000523228 545 ntTSL 417.28■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-228ENST00000523828 607 ntTSL 516.93■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-219ENST00000521565 547 ntTSL 416.4■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 415.81■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-207ENST00000474033 1171 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.05□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 312.46□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.3□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-17■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-206ENST00000492266 413 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 410.37□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.752e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.232e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.592e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.342e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-205ENST00000482963 1555 ntTSL 221.96■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 220.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 47.3
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