Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 SLC35A4-204ENST00000623481 683 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.489e-10■■■■■ 48.5
PCBP1Q15365 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 48.4
PCBP1Q15365 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 48.4
PCBP1Q15365 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.694e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-205ENST00000440812 1190 ntTSL 523.18■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 419.86■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 519.14■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-206ENST00000564934 639 ntTSL 314.45□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-204ENST00000562303 5897 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.954e-8■■■■■ 48.3
PCBP1Q15365 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.622e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-22■■■■■ 47.9
PCBP1Q15365 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 317.68■□□□□ 0.424e-17■■■■■ 47.6
PCBP1Q15365 MTG1-204ENST00000473735 2212 ntTSL 523.07■■□□□ 1.283e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.273e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.063e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.993e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-207ENST00000495014 871 ntTSL 320.83■□□□□ 0.933e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.833e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-221ENST00000521830 580 ntTSL 420.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-211ENST00000520136 468 ntTSL 319.84■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-218ENST00000521330 556 ntTSL 419.3■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-224ENST00000522577 702 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-223ENST00000522200 855 ntTSL 318.98■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.76■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.72■□□□□ 0.593e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-210ENST00000520118 533 ntTSL 418.54■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-208ENST00000519117 617 ntTSL 318.54■□□□□ 0.563e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 218.48■□□□□ 0.553e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-222ENST00000521847 1847 ntTSL 217.98■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 417.89■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-214ENST00000520484 508 ntTSL 417.67■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 517.51■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-226ENST00000523165 375 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-227ENST00000523228 545 ntTSL 417.28■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-228ENST00000523828 607 ntTSL 516.93■□□□□ 0.33e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-219ENST00000521565 547 ntTSL 416.4■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-9■■■■■ 47.5
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PCBP1Q15365 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.083e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MXRA8-207ENST00000474033 1171 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.05□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 312.46□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.3□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-17■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MTG1-206ENST00000492266 413 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 410.37□□□□□ -0.753e-9■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 47.5
PCBP1Q15365 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 47.4
PCBP1Q15365 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.752e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.232e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.592e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.342e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 LHPP-205ENST00000482963 1555 ntTSL 221.96■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 220.39■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 47.3
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