Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPAQ15257 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPAQ15257 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPAQ15257 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPAQ15257 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPAQ15257 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPAQ15257 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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